Sendo a FAFIRE uma faculdade católica tem a responsabilidade, na sociedade de integrar ciência e fé; não a ciência como um conjunto de certezas absolutas e nem a fé como conjunto de dogmas estabelecidas mas, como lugar da livre investigação que visa a excelência, o pioneirismo, a produção e a divulgação do conhecimento. Aqui, entre ciência e fé e entre mundo moderno e cristianismo não há conflito, mas diálogo. Compreende que o compromisso com a paz começa dentro de sua própria casa, no relacionamento com o próximo, na capacidade de pensar livremente e de pensar diferente. Amar o próximo, ainda que ele pense diferente, significa antes de tudo respeitá-lo e garantir que tenha seus direitos respeitados. A FAFIRE é uma faculdade católica – não se abre mão dessa confessionalidade – mas é aberta ao ecumenismo e ao diálogo inter-religioso. É função de uma faculdade católica ser um lugar onde pode se manifestar a consciência da Igreja em relação ao valor da cultura; lugar onde pode-se realizar o diálogo com o mundo contemporâneo; lugar do desenvolvimento de uma pastoral da inteligência, de uma pastoral da ciência e de uma pastoral da cultura.